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2003年，非典型肺炎過后，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院（簡稱“廣州健康院”）在中國科學院、廣東省、廣州市共建三方的見證下應運而生，于2006年3月正式成立。廣州健康院是中科院首個面向地方經濟社會的發展需求、在實施“知識創新工程”試點中與地方共建的研究所，首次采取院、省、市聯合共建以及理事會領導下的院長負責制的全新運行體制機制。研究院的成立填補了當時華南地區生物醫藥領域國立科研機構的空白，對中國新型研發機構實有篳路藍縷的探索之功。
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